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使用 NUMA 感知的内存管理器

特性状态: Kubernetes v1.22 [beta]

Kubernetes 内存管理器(Memory Manager)为 Guaranteed QoS 类 的 Pods 提供可保证的内存(及大页面)分配能力。

内存管理器使用提示生成协议来为 Pod 生成最合适的 NUMA 亲和性配置。 内存管理器将这类亲和性提示输入给中央管理器(即 Topology Manager)。 基于所给的提示和 Topology Manager(拓扑管理器)的策略设置,Pod 或者会被某节点接受,或者被该节点拒绝。

此外,内存管理器还确保 Pod 所请求的内存是从尽量少的 NUMA 节点分配而来。

内存管理器仅能用于 Linux 主机。

准备开始

你必须拥有一个 Kubernetes 的集群,同时你的 Kubernetes 集群必须带有 kubectl 命令行工具。 建议在至少有两个节点的集群上运行本教程,且这些节点不作为控制平面主机。 如果你还没有集群,你可以通过 Minikube 构建一个你自己的集群,或者你可以使用下面任意一个 Kubernetes 工具构建:

你的 Kubernetes 服务器版本必须不低于版本 v1.21. 要获知版本信息,请输入 kubectl version.

为了使得内存资源与 Pod 规约中所请求的其他资源对齐:

  • CPU 管理器应该被启用,并且在节点(Node)上要配置合适的 CPU 管理器策略, 参见控制 CPU 管理策略
  • 拓扑管理器要被启用,并且要在节点上配置合适的拓扑管理器策略,参见 控制拓扑管理器策略

从 v1.22 开始,内存管理器通过特性门控 MemoryManager 默认启用。

在 v1.22 之前,kubelet 必须在启动时设置如下标志:

--feature-gates=MemoryManager=true

这样内存管理器特性才会被启用。

内存管理器如何运作?

内存管理器目前为 Guaranteed QoS 类中的 Pod 提供可保证的内存(和大页面)分配能力。 若要立即将内存管理器启用,可参照内存管理器配置节中的指南, 之后按将 Pod 放入 Guaranteed QoS 类 节中所展示的,准备并部署一个 Guaranteed Pod。

内存管理器是一个提示驱动组件(Hint Provider),负责为拓扑管理器提供拓扑提示, 后者根据这些拓扑提示对所请求的资源执行对齐操作。 内存管理器也会为 Pods 应用 cgroups 设置(即 cpuset.mems)。 与 Pod 准入和部署流程相关的完整流程图在Memory Manager KEP: Design Overview, 下面也有说明。

Pod 准入与部署流程中的内存管理器

在这个过程中,内存管理器会更新其内部存储于节点映射和内存映射中的计数器, 从而管理有保障的内存分配。

内存管理器在启动和运行期间按下述逻辑更新节点映射(Node Map)。

启动

当节点管理员应用 --reserved-memory 预留内存标志时执行此逻辑。 这时,节点映射会被更新以反映内存的预留,如 Memory Manager KEP: Memory Maps at start-up (with examples) 所说明。

当配置了 Static 策略时,管理员必须提供 --reserved-memory 标志设置。

运行时

参考文献 Memory Manager KEP: Memory Maps at runtime (with examples) 中说明了成功的 Pod 部署是如何影响节点映射的,该文档也解释了可能发生的内存不足 (Out-of-memory,OOM)情况是如何进一步被 Kubernetes 或操作系统处理的。

在内存管理器运作的语境中,一个重要的话题是对 NUMA 分组的管理。 每当 Pod 的内存请求超出单个 NUMA 节点容量时,内存管理器会尝试创建一个包含多个 NUMA 节点的分组,从而扩展内存容量。解决这个问题的详细描述在文档 Memory Manager KEP: How to enable the guaranteed memory allocation over many NUMA nodes? 中。同时,关于 NUMA 分组是如何管理的,你还可以参考文档 Memory Manager KEP: Simulation - how the Memory Manager works? (by examples)

内存管理器配置

其他管理器也要预先配置。接下来,内存管理器特性需要被启用, 并且采用 Static 策略(静态策略)运行。 作为可选操作,可以预留一定数量的内存给系统或者 kubelet 进程以增强节点的稳定性 (预留内存标志)。

策略

内存管理器支持两种策略。你可以通过 kubelet 标志 --memory-manager-policy 来选择一种策略:

  • None (默认)
  • Static

None 策略

这是默认的策略,并且不会以任何方式影响内存分配。该策略的行为好像内存管理器不存在一样。

None 策略返回默认的拓扑提示信息。这种特殊的提示会表明拓扑驱动组件(Hint Provider) (在这里是内存管理器)对任何资源都没有与 NUMA 亲和性关联的偏好。

Static 策略

Guaranteed Pod 而言,Static 内存管理器策略会返回拓扑提示信息, 该信息与内存分配有保障的 NUMA 节点集合有关,并且内存管理器还通过更新内部的节点映射 对象来完成内存预留。

BestEffortBurstable Pod 而言,因为不存在对有保障的内存资源的请求, Static 内存管理器策略会返回默认的拓扑提示,并且不会通过内部的节点映射对象来预留内存。

预留内存标志

节点可分配机制通常被节点管理员用来为 kubelet 或操作系统进程预留 K8S 节点上的系统资源,目的是提高节点稳定性。 有一组专用的标志可用于这个目的,为节点设置总的预留内存量。 此预配置的值接下来会被用来计算节点上对 Pods “可分配的”内存。

Kubernetes 调度器在优化 Pod 调度过程时,会考虑“可分配的”内存。 前面提到的标志包括 --kube-reserved--system-reserved--eviction-threshold。 这些标志值的综合计作预留内存的总量。

为内存管理器而新增加的 --reserved-memory 标志可以(让节点管理员)将总的预留内存进行划分, 并完成跨 NUMA 节点的预留操作。

标志设置的值是一个按 NUMA 节点的不同内存类型所给的内存预留的值的列表,用逗号分开。 可以使用分号作为分隔符来指定跨多个 NUMA 节点的内存预留。 只有在内存管理器特性被启用的语境下,这个参数才有意义。 内存管理器不会使用这些预留的内存来为容器负载分配内存。

例如,如果你有一个可用内存为 10Gi 的 NUMA 节点 "NUMA0",而参数 --reserved-memory 被设置成要在 "NUMA0" 上预留 1Gi 的内存,那么内存管理器会假定节点上只有 9Gi 内存可用于容器负载。

你也可以忽略此参数,不过这样做时,你要清楚,所有 NUMA 节点上预留内存的数量要等于节点可分配特性 所设定的内存量。如果至少有一个节点可分配参数值为非零,你就需要至少为一个 NUMA 节点设置 --reserved-memory。实际上,eviction-hard 阈值默认为 100Mi, 所以当使用 Static 策略时,--reserved-memory 是必须设置的。

此外,应尽量避免如下配置:

  1. 重复的配置,即同一 NUMA 节点或内存类型被设置不同的取值;
  2. 为某种内存类型设置约束值为零;
  3. 使用物理硬件上不存在的 NUMA 节点 ID;
  4. 使用名字不是 memoryhugepages-<size> 的内存类型名称 (特定的 <size> 的大页面也必须存在)。

语法:

--reserved-memory N:memory-type1=value1,memory-type2=value2,...

  • N(整数)- NUMA 节点索引,例如,0
  • memory-type(字符串)- 代表内存类型:
    • memory - 常规内存;
    • hugepages-2Mihugepages-1Gi - 大页面
  • value(字符串) - 预留内存的量,例如 1Gi

用法示例:

--reserved-memory 0:memory=1Gi,hugepages-1Gi=2Gi

或者

--reserved-memory 0:memory=1Gi --reserved-memory 1:memory=2Gi

--reserved-memory '0:memory=1Gi;1:memory=2Gi'

当你为 --reserved-memory 标志指定取值时,必须要遵从之前通过节点可分配特性标志所设置的值。 换言之,对每种内存类型而言都要遵从下面的规则:

sum(reserved-memory(i)) = kube-reserved + system-reserved + eviction-threshold

其中,i 是 NUMA 节点的索引。

如果你不遵守上面的公式,内存管理器会在启动时输出错误信息。

换言之,上面的例子我们一共要预留 3Gi 的常规内存(type=memory),即:

sum(reserved-memory(i)) = reserved-memory(0) + reserved-memory(1) = 1Gi + 2Gi = 3Gi

下面的例子中给出与节点可分配配置相关的 kubelet 命令行参数:

  • --kube-reserved=cpu=500m,memory=50Mi
  • --system-reserved=cpu=123m,memory=333Mi
  • --eviction-hard=memory.available<500Mi

下面是一个正确配置的示例:

--feature-gates=MemoryManager=true
--kube-reserved=cpu=4,memory=4Gi
--system-reserved=cpu=1,memory=1Gi
--memory-manager-policy=Static
--reserved-memory '0:memory=3Gi;1:memory=2148Mi'

我们对上面的配置做一个检查:

  1. kube-reserved + system-reserved + eviction-hard(default) = reserved-memory(0) + reserved-memory(1)
  2. 4GiB + 1GiB + 100MiB = 3GiB + 2148MiB
  3. 5120MiB + 100MiB = 3072MiB + 2148MiB
  4. 5220MiB = 5220MiB (这是对的)

将 Pod 放入 Guaranteed QoS 类

若所选择的策略不是 None,则内存管理器会辨识处于 Guaranteed QoS 类中的 Pod。 内存管理器为每个 Guaranteed Pod 向拓扑管理器提供拓扑提示信息。 对于不在 Guaranteed QoS 类中的其他 Pod,内存管理器向拓扑管理器提供默认的拓扑提示信息。

下面的来自 Pod 清单的片段将 Pod 加入到 Guaranteed QoS 类中。

当 Pod 的 CPU requests 等于 limits 且为整数值时,Pod 将运行在 Guaranteed QoS 类中。

spec:
  containers:
  - name: nginx
    image: nginx
    resources:
      limits:
        memory: "200Mi"
        cpu: "2"
        example.com/device: "1"
      requests:
        memory: "200Mi"
        cpu: "2"
        example.com/device: "1"

此外,共享 CPU 的 Pods 在 requests 等于 limits 值时也运行在 Guaranteed QoS 类中。

spec:
  containers:
  - name: nginx
    image: nginx
    resources:
      limits:
        memory: "200Mi"
        cpu: "300m"
        example.com/device: "1"
      requests:
        memory: "200Mi"
        cpu: "300m"
        example.com/device: "1"

要注意的是,只有 CPU 和内存请求都被设置时,Pod 才会进入 Guaranteed QoS 类。

故障排查

下面的方法可用来排查为什么 Pod 无法被调度或者被节点拒绝:

  • Pod 状态 - 可表明拓扑亲和性错误
  • 系统日志 - 包含用来调试的有价值的信息,例如,关于所生成的提示信息
  • 状态文件 - 其中包含内存管理器内部状态的转储(包含节点映射和内存映射
  • 从 v1.22 开始,设备插件资源 API 可以用来检索关于为容器预留的内存的信息

Pod 状态 (TopologyAffinityError)

这类错误通常在以下情形出现:

  • 节点缺少足够的资源来满足 Pod 请求
  • Pod 的请求因为特定的拓扑管理器策略限制而被拒绝

错误信息会出现在 Pod 的状态中:

kubectl get pods
NAME         READY   STATUS                  RESTARTS   AGE
guaranteed   0/1     TopologyAffinityError   0          113s

使用 kubectl describe pod <id>kubectl get events 可以获得详细的错误信息。

Warning  TopologyAffinityError  10m   kubelet, dell8  Resources cannot be allocated with Topology locality

系统日志

针对特定的 Pod 搜索系统日志。

内存管理器为 Pod 所生成的提示信息可以在日志中找到。 此外,日志中应该也存在 CPU 管理器所生成的提示信息。

拓扑管理器将这些提示信息进行合并,计算得到唯一的最合适的提示数据。 此最佳提示数据也应该出现在日志中。

最佳提示表明要在哪里分配所有的资源。拓扑管理器会用当前的策略来测试此数据, 并基于得出的结论或者接纳 Pod 到节点,或者将其拒绝。

此外,你可以搜索日志查找与内存管理器相关的其他条目,例如 cgroupscpuset.mems 的更新信息等。

检查节点上内存管理器状态

我们首先部署一个 Guaranteed Pod 示例,其规约如下所示:

apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
  name: guaranteed
spec:
  containers:
  - name: guaranteed
    image: consumer
    imagePullPolicy: Never
    resources:
      limits:
        cpu: "2"
        memory: 150Gi
      requests:
        cpu: "2"
        memory: 150Gi
    command: ["sleep","infinity"]

接下来,我们登录到 Pod 运行所在的节点,检查位于 /var/lib/kubelet/memory_manager_state 的状态文件:

{
   "policyName":"Static",
   "machineState":{
      "0":{
         "numberOfAssignments":1,
         "memoryMap":{
            "hugepages-1Gi":{
               "total":0,
               "systemReserved":0,
               "allocatable":0,
               "reserved":0,
               "free":0
            },
            "memory":{
               "total":134987354112,
               "systemReserved":3221225472,
               "allocatable":131766128640,
               "reserved":131766128640,
               "free":0
            }
         },
         "nodes":[
            0,
            1
         ]
      },
      "1":{
         "numberOfAssignments":1,
         "memoryMap":{
            "hugepages-1Gi":{
               "total":0,
               "systemReserved":0,
               "allocatable":0,
               "reserved":0,
               "free":0
            },
            "memory":{
               "total":135286722560,
               "systemReserved":2252341248,
               "allocatable":133034381312,
               "reserved":29295144960,
               "free":103739236352
            }
         },
         "nodes":[
            0,
            1
         ]
      }
   },
   "entries":{
      "fa9bdd38-6df9-4cf9-aa67-8c4814da37a8":{
         "guaranteed":[
            {
               "numaAffinity":[
                  0,
                  1
               ],
               "type":"memory",
               "size":161061273600
            }
         ]
      }
   },
   "checksum":4142013182
}

从这个状态文件,可以推断 Pod 被同时绑定到两个 NUMA 节点,即:

"numaAffinity":[
   0,
   1
],

术语绑定(pinned)意味着 Pod 的内存使用被(通过 cgroups 配置)限制到这些 NUMA 节点。

这也直接意味着内存管理器已经创建了一个 NUMA 分组,由这两个 NUMA 节点组成, 即索引值分别为 01 的 NUMA 节点。

注意 NUMA 分组的管理是有一个相对复杂的管理器处理的, 相关逻辑的进一步细节可在内存管理器的 KEP 中示例1跨 NUMA 节点节找到。

为了分析 NUMA 组中可用的内存资源,必须对分组内 NUMA 节点对应的条目进行汇总。

例如,NUMA 分组中空闲的“常规”内存的总量可以通过将分组内所有 NUMA 节点上空闲内存加和来计算,即将 NUMA 节点 0 和 NUMA 节点 1"memory" 节 (分别是 "free":0"free": 103739236352)相加,得到此分组中空闲的“常规” 内存总量为 0 + 103739236352 字节。

"systemReserved": 3221225472 这一行表明节点的管理员使用 --reserved-memory 为 NUMA 节点 0 上运行的 kubelet 和系统进程预留了 3221225472 字节 (即 3Gi)。

设备插件资源 API

kubelet 提供了一个 PodResourceLister gRPC 服务来启用对资源和相关元数据的检测。 通过使用它的 List gRPC 端点, 可以获得每个容器的预留内存信息,该信息位于 protobuf 协议的 ContainerMemory 消息中。 只能针对 Guaranteed QoS 类中的 Pod 来检索此信息。

接下来